Valkyria Chronicles 4, ilk Valkyria Chronicles ile aynı zaman diliminde geçer, ancak Federasyonun E Mangasına odaklanır. Komutan Claude Wallace ve çocukluk arkadaşları bu umutsuz savaşta özgürlük için mücadeleye atılır. Ancak dondurucu kar fırtınaları, dalgalar hâlinde gelen imparatorluk askerleri ve Valkyria’nın tanrısal güçleri, onlarla zaferin arasında durur.