Valkyria Chronicles 4は、初代Valkyria Chroniclesと同じ時期を舞台に、連邦のE小隊に焦点を当てます。指揮官Claude Wallaceと幼なじみたちは、この絶望的な戦争で自由のために戦いに赴きます。しかし、身を凍らせる吹雪、押し寄せる帝国兵、そしてValkyriaの神にも等しい力が、彼らと勝利の間に立ちはだかります。