Gioca nei panni di Marcus Holloway, un brillante giovane hacker che vive nella culla della rivoluzione tecnologica, la zona della baia di San Francisco.
Fai squadra con Dedsec, un famigerato gruppo di hacker, per compiere il più grande attacco informatico della storia: abbattere ctOS 2.0, un sistema operativo invasivo usato da menti criminali per sorvegliare e manipolare i cittadini su vasta scala.