Os irmãos voltam para uma aventura inédita em alto-mar! Embarque com Mario e Luigi na Ilha Nauta, parte navio e parte ilha, e viaje pelo vasto mundo de Elétria. Lance-se do canhão da Ilha Nauta para visitar, explorar e cumprir missões em ilhas que vão de florestas tropicais a cidades agitadas. Pelo caminho, faça novos amigos, como Tetê e Pligue, que definitivamente não é um porco, e encontre rostos conhecidos do Reino Cogumelo, como Peach e Bowser, que podem ajudar ou atrapalhar sua jornada!

Você terá que contar com o laço fraternal de Mario e Luigi para vencer. Use as ações Bros. para superar obstáculos enquanto explora e os poderosos ataques Bros. em uma versão dinâmica dos combates por turnos. Você vai precisar de todas as vantagens que essa união entre irmãos oferece para salvar o dia!