身に覚えのない罪で告発されたKeisuke Amazawaには、デジタルワールドへ飛び込み、無実を証明するために調査するしか道がない。たとえハッカー集団に加わり、この謎めいた宇宙を脅かす問題の解決を手伝うことになっても。

現実とデジタルの間に、真実がある！

— サイバーパンクの雰囲気
現実とデジタルが交わる場所で、より深く暗い冒険へ飛び込もう
— 奥深く夢中になるゲームプレイ！
320体以上のDigimonを発見し、冒険、育成、戦闘が絶妙に融合した体験を楽しもう！
— Digimonのスキル、相性、コンボで強化された王道のターン制プレイで、より幅広い戦闘戦略を楽しもう。
— 語られなかった物語
“Digimon Story: Cyber Sleuth”で起きた事件の謎めいた裏側を発見しよう。